Уткин А.В. Фомин В.М. Ожгибесов М.С.Применение технологий CUDA и MPI к решению задач молекулярной динамики.Докладчик: Уткин А.В.
Одним из наиболее сложных моментов при выполнении моделирования в рамках метода молекулярной динамики является значительное расчетное время задачи даже для сравнительно небольших систем атомов. На сегодняшний день существуют два основных способа решения данной проблемы. Первый способ состоит в использовании и создании высокоэффективных параллельных масштабируемых кодов с использованием программного интерфейса MPI (Message Passing Interface - интерфейс передачи сообщений) для высокопроизводительных параллельных кластеров с разделенной памятью. Вторым перспективным направлением является создание параллельных алгоритмов и кодов, которые позволят проводить вычисления с использованием графических процессоров общего назначения компании NVIDIA, поддерживающих технологию CUDA. Использование этих методик позволяет изучать системы, состоящие из миллионов атомов, т.е. имеющие качественно иной масштаб, по сравнению с системами, динамика которых рассчитывается на персональных компьютерах.
К списку докладов |